خلال فترة سينغوكو، وهي فترة الحروب والانتفاضات المستمرة، كانت تونداباياشي مدينة مستقلة دينيًا ذات جدران ترابية وخندق يتمركز حول فرع معبد كوشوجي التابع لطائفة إيكو. كانت البلدة تسمى في الأصل روكوسوجي ناناتشو، وتم إنشاء بوابات كيدو في أربعة مواقع حول محيطها، على بعد حوالي 400 متر من الشرق إلى الغرب و350 متر من الشمال إلى الجنوب، وكانت البوابات تغلق ليلاً للحفاظ على النظام العام. واليوم، تظل أجزاء الماضي المنظمة بدقة تقريبًا كما كانت، وتذكرنا بقايا الجدران الترابية وخندق الحراسة المحفوظة جزئيًا بالماضي البعيد. تضم مدينة جونومون-سوجي، التي تمتد من الشمال إلى الجنوب عبر وسط المدينة، حاليًا حوالي 600 منزل مستقل، منها حوالي 250 منزلًا تقليديًا، مما يمنحها إحساسًا بالتاريخ والأسلوب. يعد ``مسكن عائلة سوجياما القديم''، الذي يقع في جنوب غرب المدينة، ملكية ثقافية مهمة محددة على المستوى الوطني، و``مسكن عائلة ناكامورا'' هو ملكية ثقافية مادية مخصصة من قبل المحافظة. تم تعيين المنطقة بأكملها كمنطقة حماية ذات أهمية وطنية لمجموعات المباني التقليدية.